יש MRI ויש Contrast-enhanced MRI, כשמזריקים חומרי ניגוד.
לא עושים contrast enhanced בלי צורך מיוחד (בד"כ מחלות מוח, התקפי לב וסוגי סרטן למיניהם - כשרוצים לקבל תמונה טובה של כלי הדם ו\או הלימפה).

כמו כן, הציטוט הבא אומר ש-FDA התיחס לזה ולא מצא סיבה להחשיב את השאריות האלה כמזיקות לבריאות:
Just last month, the FDA similarly concluded that there are no adverse health effects from gadolinium retained in the brain after contrast MRI, so restricting use of the agent is not warranted. But the agency said it would have a public meeting on the issue in the future.
למרות ש-FDA גם הוציאו המלצה לא להשתמש בחומרי הניגוד ב-MRI ללא צורך ממשי.